C'est à nouveau l'heure du duel, mais cette fois avec Judaï et ses amis au sein de la prestigieuse Duel Academia. Sauront-ils prouver leur valeur ?Voici le duel tant attendu contre Kaiser Ryô ! Manjôme abat sans hésiter sa meilleure carte « Light and Darkness Dragon » ! Pourtant, Kaiser montre un sourire qui prouve sa maîtrise de la situation... Pendant ce temps, Jûdaï affronte Reggie MacKenzie dans un duel des ténèbres pour sauver le professeur Hibiki !