C'est à nouveau l'heure du duel, mais cette fois avec Judaï et ses amis au sein de la prestigieuse Duel Academia. Sauront-ils prouver leur valeur ?Nous voici au duel final entre Jûdaï et Manjôme. Le public s'enflamme pour ce duel sans merci !! Qui va gagner ?! Quant à Reggie MacKenzie, elle défie le professeur Hibiki en lui proposant un effrayant duel des ténèbres... L'enjeu de ce duel ? MacKenzie promet de lui dévoiler la solution pour sortir son frère Kôyô du coma...!!