Anakin Skywalker et le reste de son équipe Jedi ont été envahis par l'attaque surprise des Séparatistes menés par Riff Tamson. Le jeune prince Lee-Char et Ahsoka doivent alors éviter d'être capturés. Devant l'impossibilité d'envoyer plus d'aide de la République, Yoda appelle à l'aide la puissante Armée Gungan, mais leurs forces ne seront peut être pas suffisantes face à l'assaut Séparatiste. Tamson redouble d'efforts dans la traque du Prince Lee Char, déchaînant les renforts fournis par le Comte Dooku.