Docteur Shaun Murphy (Freddie Highmore), un jeune chirurgien atteint du syndrome d'autiste savant, continue d’exercer ses extraordinaires dons médicaux à l'Hôpital Saint-Bonaventure. Au fur et à mesure que sa relation amoureuse avec Lea s'approfondit, il fait également face à de nouvelles responsabilités en tant que résident de quatrième année, lorsqu'il est chargé de superviser un nouvel ensemble de résidents qui vont le mettre à l’épreuve d’une façon inattendue. Pendant ce temps, l'équipe doit faire face à la pandémie de COVID-19 qui a submergé l’Hôpital de Saint-Bonaventure.